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6163am银河线路生物医学工程系毕业生王珏皛在核酸杂交探针方面取得突破性成果
2015.12.22

日前,6163am银河线路生物医学工程系09级本科毕业生王珏皛(本科毕业设计导师:生物医学工程系朱怀球">朱怀球教授)在其研究生导师——Rice大学生物工程师David Zhang及合作者的带领下发明出了一种独特方法来实时调整核酸探针试剂,并对靶序列结合成功进行了可靠的量化。

该方法能够连续可调地定位和量化DNA和RNA中的生物标志物,对于疾病的检测和治疗方案设计至关重要。这项工作近日发表在Nature Methods期刊,论文第一作者是为王珏皛。


图为Rice 大学的研究人员Lucia Wu(左), David Zhang(中)和王珏皛(J. Sherry Wang,右)。Photo by Jeff Fitlow

分析DNA和RNA的序列,尤其是分析突变部分的序列对于疾病检测和治疗至关重要,但是在巨量的基因编码中找到特定的生物标志物却异常困难。以往的方法是用荧光探针去结合相应的靶序列,结合成功的部位会发出可见的荧光。但是这种方法具有很高的局限性,探针的荧光强度不可调节,过亮或过暗都会对实验结果产生误差。Zhang教授的团队解决了这一问题。他们合成了一种DNA保护剂,这种保护剂能模仿靶序列DNA,和真正的靶序列DNA竞争去结合相应荧光探针。这样就可以通过改变反应底物(探针、靶DNA、保护剂等)浓度,影响化学反应的平衡点,改变探针与靶序列的结合程度,从而可以改变调整探针结合的荧光强度,使得生物标志物检测更为精确。

Zhang与王珏皛等研究人员已开发了相应软件http://nablab.rice.edu/nabtools/,可以实现让研究人员自己设计探针。该软件能使研究人员剪切和粘贴基因序列并标注目标区域来生成探针。这一工作的作者是王珏皛(第一作者)和David Yu Zhang,2015年发表在Nature Chemistry上。

Zhang与王珏皛共同创立了Searna Technologies公司,来进一步开发这项技术,并将其应用于癌症等疾病的检测。

 

相关链接:
http://www.nature.com/nmeth/journal/vaop/ncurrent/full/nmeth.3626.html
http://www.nature.com/nchem/journal/v7/n7/full/nchem.2266.html
http://bioengineering.rice.edu/biomarker_finder.aspx